知网查重和杂志社查重的区别在于应用场景和侧重点不同。知网查重主要应用于学术论文领域，重点关注学术文献的原创性和学术规范性，而杂志社查重则更注重对投稿论文的原创性和学术质量的评估。知网查重工具通常提供学术界常用的查重标准和规则，帮助作者确保论文的学术合规性，而杂志社查重则可能根据期刊的特定要求和标准进行评估。此外，知网查重工具可能提供更详细的文献相似度报告和引用分析，帮助作者更全面地了解论文的学术质量，而杂志社查重则可能更侧重于对论文的学术创新性和贡献度的评估。

另外，知网查重工具通常提供广泛的学术文献数据库支持，能够覆盖更多领域的学术文献，帮助作者更全面地进行文献查重和引用分析，而杂志社查重可能更倾向于对特定领域或主题的文献进行查重和评估。因此，针对不同的论文投稿需求，作者可以根据具体情况选择合适的查重工具。总的来说，知网查重和杂志社查重在应用场景、侧重点和支持范围等方面存在一定差异，作者应根据自身的投稿需求和期刊要求合理选择查重工具，以确保论文的学术质量和合规性。