知网查重工具在识别文章章节时，主要依赖于文本内容的相似度比对。但由于章节结构、格式、标点等因素的影响，可能导致查重结果不准确。此外，知网查重算法可能对章节划分的连续性、段落长度等要求较高，如果文章结构复杂或格式不规范，会影响查重效果。针对此问题，建议优化文章结构，规范格式，尽量避免章节间的断裂，以提高知网查重的准确性。

另外，知网查重工具可能受限于文本处理算法和技术手段，对于特定格式、排版不规范的文章，识别章节边界可能存在困难。在使用知网查重时，可以尝试调整文章格式，增加段落间的连接性，减少特殊格式的应用，以提高查重结果的准确性。同时，定期更新知网查重工具版本，关注官方发布的优化更新，也有助于提升查重效果。